Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ
-
Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
нарастить скилы чрезвычайно сложно
За одну попытку. Но этих попыток ,в отдельно взятом человеке даже , сколько будет? Поэтому фактор скорости я упомянул.
Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
Поэтому фактор скорости я упомянул.
миллионы лет эволюции
В случае монотерапии ралтегравиром , вирусу потребуется пару месяцев эволюции чтобы вырастить броню к ралу.
-
Группа исследователей из Института рака им. Фрэнсиса Крика в Лондоне и Института онкологии Дейни-Фарбера в Бостоне описала механизм, лежащий в основе того, как ВИЧ развивает резистентность к антиретровирусным препаратам из класса ингибиторов переноса цепи интегразой. По мнению специалистов, полученные ими данные открывают путь к разработке более эффективных методов лечения.
В настоящее время существует широкий спектр лекарственных средств, помогающих держать ВИЧ-инфекцию под контролем. К их чилу относятся препараты из класса ингибиторов переноса цепи интегразой: ралтегравир, элвитегравир, долутегравир и биктегравир. Все они работают, связываясь с одним из ключевых ферментов ВИЧ – интегразой, чтобы помешать ему вставить генетическую информацию о вирусе в ДНК клеток человека. Однако, несмотря на то, что изначально данные средства обладали высокой эффективностью, с течением времени ВИЧ способен развить устойчивость к ним.
Подробнее:
https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-01/tfci-hhd013020.php
-
@васьвась Ужас,что же делать?
Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
что же делать?
Ничего. Ждать коронавирус ☠
-
Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
Поэтому фактор скорости я упомянул.
миллионы лет эволюции
В случае монотерапии ралтегравиром , вирусу потребуется пару месяцев эволюции чтобы вырастить броню к ралу.
@васьвась ну, и так же потеряет эти мутации, т.к. мутация дает выгоды только локальные, там, где есть комплект дурака и монотерапии ралтегравиром. А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато. Но, тут CAP-теорема в действии )
-
@васьвась ну, и так же потеряет эти мутации, т.к. мутация дает выгоды только локальные, там, где есть комплект дурака и монотерапии ралтегравиром. А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато. Но, тут CAP-теорема в действии )
Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато.
Ралтегравира мало. Пихают и будут пихать еще не один год ННИОТы наивным. Хотя к ним первичной резистентности хватает. Следом вылетают и НИОТы из такой схемы. А так как генотипирование делается редко и далеко не в каждом городе, то смена схемы происходит наобум и далее вылетают препараты других классов, оставшиеся один на один с вирусом. Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны, но схема эволюции ±такова .
Короче, Мурашко, давай готовь Фостемсавир и Трогарзо. -
Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато.
Ралтегравира мало. Пихают и будут пихать еще не один год ННИОТы наивным. Хотя к ним первичной резистентности хватает. Следом вылетают и НИОТы из такой схемы. А так как генотипирование делается редко и далеко не в каждом городе, то смена схемы происходит наобум и далее вылетают препараты других классов, оставшиеся один на один с вирусом. Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны, но схема эволюции ±такова .
Короче, Мурашко, давай готовь Фостемсавир и Трогарзо.Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны
Но видимо начинают собирать данные. Меня на днях предупредили в сц, что вызовут взять кровь. Повезут ее в Новосибирск. Только нахрена им мой штамм 90-х годов рождения, да еще и с неопределяемой ВН - загадка.
-
Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны
Но видимо начинают собирать данные. Меня на днях предупредили в сц, что вызовут взять кровь. Повезут ее в Новосибирск. Только нахрена им мой штамм 90-х годов рождения, да еще и с неопределяемой ВН - загадка.
-
-
Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны
Но видимо начинают собирать данные. Меня на днях предупредили в сц, что вызовут взять кровь. Повезут ее в Новосибирск. Только нахрена им мой штамм 90-х годов рождения, да еще и с неопределяемой ВН - загадка.
-
Тоже интересно:
-
-
Я вот справно кушаю ral + 3tc + taf. Мне следовало бы задуматься о смене ral на что-нибудь другое?
-
Тоже интересно:
-
[[topic:post-is-deleted]]
Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
нельзя вместе с терой принимать магний ,цинк и все, что связано с металлами
Тогда ты умрешь. Хотя с водой тоже металлы заносятся. Значит надо отказаться от воды тоже . А в воздухе - свинец и другой ужас. Все, приплыли 🤷♂️
Нет. Все не так. Одновременно кое-что нельзя принимать. Но по другой причине, указанной в инструкции.
-
Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
нельзя вместе с терой принимать магний ,цинк и все, что связано с металлами
Тогда ты умрешь. Хотя с водой тоже металлы заносятся. Значит надо отказаться от воды тоже . А в воздухе - свинец и другой ужас. Все, приплыли 🤷♂️
Нет. Все не так. Одновременно кое-что нельзя принимать. Но по другой причине, указанной в инструкции.
@васьвась Действительно, без металлов никак. А вот интересно ,эта устойчивость наблюдалась в лабораториях, но в жизни пока нет? Это пока предупреждалка, но по каким то причинам может им. место. Но как предупредить это неизвестно по той причине,что неизбежно(((((
-
Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
нельзя вместе с терой принимать магний ,цинк и все, что связано с металлами
Тогда ты умрешь. Хотя с водой тоже металлы заносятся. Значит надо отказаться от воды тоже . А в воздухе - свинец и другой ужас. Все, приплыли 🤷♂️
Нет. Все не так. Одновременно кое-что нельзя принимать. Но по другой причине, указанной в инструкции.
-
[[topic:post-is-deleted]]
@ladymusik63 вы путаете тонкие внутриклеточные процессы с процессами вообще другого уровня и других действующих лиц даже.
-
@ladymusik63 вы путаете тонкие внутриклеточные процессы с процессами вообще другого уровня и других действующих лиц даже.
@ilya-antipin Спасибо, потому и спрашиваю, поскольку не биомедик.
-
@Gremlin , объясни, как это неживое, безмозглое существо делает такие продуманные ходы?
Ощущение, что это какой-то искусственный сверхинтеллект.Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
как это неживое, безмозглое существо делает такие продуманные ходы?
Ощущение, что это какой-то искусственный сверхинтеллект.Из того, что нам было известно до этого исследования:
- Интеграза ВИЧ использует для связи с ДНК человека ионы металла (преимущественно ионы магния).
- Для образования координационных связей с двумя ионами металла интеграза ВИЧ задействует в своем составе активный сайт в виде DDE-мотива (2-е аспарагиновых кислоты и 1 глутаминовая).
- Для образования связи с ДНК человека интеграза в комплексе с двумя ионами металла атакует этими ионами фосфодиэфирные связи ДНК человека и получаем единый координационный хелатный комплекс.
- Обе вышеописанные реакции осуществляются с участием молекул воды (с применением гидролиза).
- ИИ (ингибитор интегразы) связывается с интегразой также через ионы металлов (указанные в п.2), блокируя тем самым связь интегразы с ДНК человека (попутно галогенбензильным кольцом, связывая еще и вирусную ДНК).
- Связь ИИ с ионами металла также происходит с применением реакции гидролиза (т.е. тоже с участием молекул воды).
- При развитии резистентности к ИИ мутантная интеграза по какой-то причине предпочитает связываться через ионы металлов не с ИИ, а с ДНК человека.
Из того, что ученым стало известно после этого исследования:
А) Ученые, используя криоэлектронную микроскопию, смогли визуализировать точную структуру активного сайта интегразы, где происходит связь с ионами металла и следовательно с ИИ.
Б) Ученые смогли увидеть механизм взаимодействия интегразы с ионами металла и ИИ.
В) Ученые узрели, что ВИЧ изменяет химическую среду в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, связанных с интегразой и это ослабляет прочные связи ИИ с интегразой. И это трещина в броне ИИ. (Слова руководителя группы ученых данного исследования Петра Черепанова).
Г) Ослабление связывания ИИ происходит из-за комбинированного эффекта мутаций и потери ключевых молекул воды в активном сайте. (Слова одной из ученых в данной группе исследования Эдины Росты).Теперь подытожим:
I. По сути, новое в данном исследовании, по сравнению с тем, что мы знали – это визуализация некоего механизма взаимодействия интегразы с ИИ, который МОЖЕТ приводить к резистентности. (Хочется надеяться, что непосредственно в статье в таком авторитетном журнале, как Science, они описали этот механизм конкретно и детально.) И то, что интеграза ослабляет связи с ионами металла в результате «обезвоживания» в активном центре ИИ.
II. Согласно п.7, по возникновению резистентности в результате мутаций интегразы, в принципе, мне кажется, многие и до этого исследования считали (т.к. вариантов здесь не особо много), что это происходит за счет увеличения по какой-то причине константы диссоциации хелатного комплекса ИИ с одной стороны, и интегразы, связанной с ионами металла, с другой стороны, по сравнению с константой диссоциации интасома ВИЧ + ДНК клетки человека (т.е., иными словами, то же, что сказал об этом исследовании в п.В Петр Черепанов).
III. Теперь остается понять потеря таких важных для ингибирования, да и интегрирования (следует из п.4 и п.6) молекул воды вблизи активного центра ИИ происходит вследствие мутаций интегразы, либо независимо от наличия мутаций интегразы всегда идет параллельным курсом и усиливается, благодаря эволюции ВИЧ, за счет привлечения каких-то иных сил (белков там ВИЧ, например и др.), но без мутаций интегразы этой потери воды пока недостаточно для развития резистентности? Т.к., исходя из формулировок п. Г и п.В это осталось неясным. Но, лично у меня, исходя из этого краткого обзора исследования получилось так:
• из п.В следует, что развитие резистентности к ИИ (= потеря брони ИИ) может происходить вследствие ослабления связи ИИ с интегразой;
• из п.В следует, что ослабление связи ИИ с интегразой происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов;
• из п. Г следует, что изменение химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов заключается в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ;
• из житейского опыта следует, что развитие резистентности к ИИ, как правило, сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы;
• таким образом, получается следующая цепочка: развитие резистентности вызвано ослаблением связи ИИ с интегразой, которое происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, которое проявляется в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ. А т.к. развитие резистентности сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы, то получается, что мутация в интегразе вызывает потерю ключевых молекул воды в активном сайте ИИ, что в конечном итоге МОЖЕТ приводить к резистентности.
P.S. на самом деле очень интересно было бы узнать какой именно физико-химический механизм вызывает потерю молекул воды в активном сайте ИИ. -
Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:
как это неживое, безмозглое существо делает такие продуманные ходы?
Ощущение, что это какой-то искусственный сверхинтеллект.Из того, что нам было известно до этого исследования:
- Интеграза ВИЧ использует для связи с ДНК человека ионы металла (преимущественно ионы магния).
- Для образования координационных связей с двумя ионами металла интеграза ВИЧ задействует в своем составе активный сайт в виде DDE-мотива (2-е аспарагиновых кислоты и 1 глутаминовая).
- Для образования связи с ДНК человека интеграза в комплексе с двумя ионами металла атакует этими ионами фосфодиэфирные связи ДНК человека и получаем единый координационный хелатный комплекс.
- Обе вышеописанные реакции осуществляются с участием молекул воды (с применением гидролиза).
- ИИ (ингибитор интегразы) связывается с интегразой также через ионы металлов (указанные в п.2), блокируя тем самым связь интегразы с ДНК человека (попутно галогенбензильным кольцом, связывая еще и вирусную ДНК).
- Связь ИИ с ионами металла также происходит с применением реакции гидролиза (т.е. тоже с участием молекул воды).
- При развитии резистентности к ИИ мутантная интеграза по какой-то причине предпочитает связываться через ионы металлов не с ИИ, а с ДНК человека.
Из того, что ученым стало известно после этого исследования:
А) Ученые, используя криоэлектронную микроскопию, смогли визуализировать точную структуру активного сайта интегразы, где происходит связь с ионами металла и следовательно с ИИ.
Б) Ученые смогли увидеть механизм взаимодействия интегразы с ионами металла и ИИ.
В) Ученые узрели, что ВИЧ изменяет химическую среду в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, связанных с интегразой и это ослабляет прочные связи ИИ с интегразой. И это трещина в броне ИИ. (Слова руководителя группы ученых данного исследования Петра Черепанова).
Г) Ослабление связывания ИИ происходит из-за комбинированного эффекта мутаций и потери ключевых молекул воды в активном сайте. (Слова одной из ученых в данной группе исследования Эдины Росты).Теперь подытожим:
I. По сути, новое в данном исследовании, по сравнению с тем, что мы знали – это визуализация некоего механизма взаимодействия интегразы с ИИ, который МОЖЕТ приводить к резистентности. (Хочется надеяться, что непосредственно в статье в таком авторитетном журнале, как Science, они описали этот механизм конкретно и детально.) И то, что интеграза ослабляет связи с ионами металла в результате «обезвоживания» в активном центре ИИ.
II. Согласно п.7, по возникновению резистентности в результате мутаций интегразы, в принципе, мне кажется, многие и до этого исследования считали (т.к. вариантов здесь не особо много), что это происходит за счет увеличения по какой-то причине константы диссоциации хелатного комплекса ИИ с одной стороны, и интегразы, связанной с ионами металла, с другой стороны, по сравнению с константой диссоциации интасома ВИЧ + ДНК клетки человека (т.е., иными словами, то же, что сказал об этом исследовании в п.В Петр Черепанов).
III. Теперь остается понять потеря таких важных для ингибирования, да и интегрирования (следует из п.4 и п.6) молекул воды вблизи активного центра ИИ происходит вследствие мутаций интегразы, либо независимо от наличия мутаций интегразы всегда идет параллельным курсом и усиливается, благодаря эволюции ВИЧ, за счет привлечения каких-то иных сил (белков там ВИЧ, например и др.), но без мутаций интегразы этой потери воды пока недостаточно для развития резистентности? Т.к., исходя из формулировок п. Г и п.В это осталось неясным. Но, лично у меня, исходя из этого краткого обзора исследования получилось так:
• из п.В следует, что развитие резистентности к ИИ (= потеря брони ИИ) может происходить вследствие ослабления связи ИИ с интегразой;
• из п.В следует, что ослабление связи ИИ с интегразой происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов;
• из п. Г следует, что изменение химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов заключается в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ;
• из житейского опыта следует, что развитие резистентности к ИИ, как правило, сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы;
• таким образом, получается следующая цепочка: развитие резистентности вызвано ослаблением связи ИИ с интегразой, которое происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, которое проявляется в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ. А т.к. развитие резистентности сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы, то получается, что мутация в интегразе вызывает потерю ключевых молекул воды в активном сайте ИИ, что в конечном итоге МОЖЕТ приводить к резистентности.
P.S. на самом деле очень интересно было бы узнать какой именно физико-химический механизм вызывает потерю молекул воды в активном сайте ИИ.
Здравствуйте! Похоже, вам интересна эта беседа, но у вас пока нет учетной записи.
Вы устали просматривать одни и те же посты каждый раз, когда заходите на сайт? После регистрации, вам не придётся искать обсуждения в которых вы принимали участие, настройте уведомления о новых сообщениях так как вам это удобно (по электронной почте или уведомлением). У вас появится возможность сохранять закладки и ставить лайки постам, чтобы выразить свою благодарность другим участникам сообщества.
С вашими комментариями этот пост может стать ещё лучше 💗
Зарегистрироваться Войти