Участник @виктория написал в Коронавирусная инфекция:
Пцр достаточно точный анализ.
Почему так много ложных?
Участник @ilya-antipin написал в Коронавирусная инфекция:
тест чей? Векторовский? Тогда могу сказать, почему.
Там нет контрольного образца, защищенной РНК, которая идет по тому же процессу, и по ней понятно, что все прошло ок. Без этой штуки работать точно почти невозможно. Там чуть не 50 на 50 происходит уже, даже в руках нерукожопого лаборанта.
Раз пошла такая «пьянка», то хотелось бы тогда своими словами описать и ознакомить читателя, а как у «них»? По каким принципам и с каким уровнем «дотошности» производится анализ на 2019-nCoV методом ОТ-ПЦР реал-тайм согласно гайду CDC от 30.03.2020. Заодно, на конкретном примере ознакомить читателя максимально подробно и простым языком с самим довольно интерсеным методом анализа ПЦР, пройдя по инструкции CDC от начала и до конца (постарался по максимуму сжать и выбрать только самое главное из инструкции, при этом старался максимально объяснить и прокомментировать потенциально непонятные читателю моменты).
ОТ-ПЦР реал-тайм 2019-nCoV
Кому интересно, ниже привожу ссылку на сайт FDA, где можно ознакомиться (скачать) с полным текстом инструкции
CDC 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV) Real-Time RT-PCR Diagnostic Panel.
Кому лень, тяжело, либо неинтересно читать весь мой обзор по ПЦР CDC на на 2019-nCoV, может глянуть только выводы:
Подытоживая, хочется отметить ряд фактов, свидетельствующих о профессиональном подходе к разработке тест-систем на 2019-nCoV и надежности данных тестов (ОТ-ПЦР реал-тайм) в США:
- Обязательное наличие положительного контроля к 2019-nCoV в каждой сессии ПЦР.
- Использование 2-х маркеров детекции 2019-nCoV.
- Обязательное наличие в каждой сессии ПЦР положительного контроля к гену человеческой РНКазы Р, свидетельствующего о корректном отборе пробы у пациента.
- Обязательное наличие в каждой сессии ПЦР отрицательного контроля, свидетельствующего об отсутствии загрязнения образцов.
- Обязательное наличие, по меньшей мере, в одной сессии ПЦР в день неинфекционного человеческого образца (достоверно без вируса 2019-nCoV) , свидетельствующего о корректном извлечении нуклеиновых кислот из образцов (корректная работа реагентов буферного лизисного раствора).
- Точность тестов, близкая к 100%, (даже лимиты детектирования взяты у американцев при условии положительного результата тестов 20 из 20 контрольных образцов, а не 19/20 (95%), например).
- Чувствительность анализа (лимиты детектирования) в зависимости от тест-системы в районе 1 копии/мкл (1000 копий/мл).
