Навигация

    Форум hiv.plus
    • Зарегистрироваться
    • Войти
    • Поиск
    • Категории
    • Последнее
    • Теги
    • Популярное
    • Поддержать проект
    А в это время на главной hiv.plus... События и перспективы | Академия | Территория редакции

    Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ

    Теоретические вопросы ВИЧ и ВИЧ-инфекции
    фундаментальные исследования
    6
    32
    3876
    Загружаем больше сообщений
    • Сначала старые
    • Сначала новые
    • По количеству голосов
    Ответить
    • Ответить, создав новую тему
    Авторизуйтесь, чтобы ответить
    Эта тема была удалена. Только пользователи с правом управления темами могут её видеть.
    • Васьвась
      Васьвась отредактировано Васьвась

      Группа исследователей из Института рака им. Фрэнсиса Крика в Лондоне и Института онкологии Дейни-Фарбера в Бостоне описала механизм, лежащий в основе того, как ВИЧ развивает резистентность к антиретровирусным препаратам из класса ингибиторов переноса цепи интегразой. По мнению специалистов, полученные ими данные открывают путь к разработке более эффективных методов лечения.

      В настоящее время существует широкий спектр лекарственных средств, помогающих держать ВИЧ-инфекцию под контролем. К их чилу относятся препараты из класса ингибиторов переноса цепи интегразой: ралтегравир, элвитегравир, долутегравир и биктегравир. Все они работают, связываясь с одним из ключевых ферментов ВИЧ – интегразой, чтобы помешать ему вставить генетическую информацию о вирусе в ДНК клеток человека. Однако, несмотря на то, что изначально данные средства обладали высокой эффективностью, с течением времени ВИЧ способен развить устойчивость к ним.

      Подробнее:

      https://www.eurekalert.org/pub_releases/2020-01/tfci-hhd013020.php

      L 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
      • Васьвась
        Васьвась отредактировано

        @Gremlin , объясни, как это неживое, безмозглое существо делает такие продуманные ходы?
        Ощущение, что это какой-то искусственный сверхинтеллект.

        Ilya Antipin Gremlin 3 ответов Последний ответ Ответить Цитировать 0
        • Ilya Antipin
          Ilya Antipin Редактор @Васьвась отредактировано

          @васьвась вирь – своего рода шука из Lego, где за казалось бы обычными кубиками, которые просто так, может стоять эволюция в миллионы лет, и что-то теряется в истории, а что-то тащится с собой и однажды позволяет продолжить существовать вирусу. Как в данном случае. Была такая книжка, Эволюция вирусов академика Жданова, в синенькой твердой обложке, я очень любил ее на младших курсах полистать.Конечно она безбожно устарела местами, но некоторые представления общего смысла формировала тогда, и поражала местами не раз.

          Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
          • Васьвась
            Васьвась @Ilya Antipin отредактировано

            Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

            эволюция

            Еще и происходит у вирусов в хрениллиарды раз быстрее. Человек за свою жизнь может сделать несколько своих потомков. Вирусы - чуть поболее.

            Ilya Antipin 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
            • Ilya Antipin
              Ilya Antipin Редактор @Васьвась отредактировано

              @васьвась эээ, фигушки )) Тут проблема «рюкзачка». Т.е. вирь и есть тот рюкзачок, в который влазит очень и очень немного, потому, вариантики перебирать можно быстро, а вот нарастить скилы чрезвычайно сложно – не лезет в «в рюкзачок». Чтобы купить что-то ненужное, нужно продать что-то ненужное.

              Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
              • Васьвась
                Васьвась @Ilya Antipin отредактировано

                Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                нарастить скилы чрезвычайно сложно

                За одну попытку. Но этих попыток ,в отдельно взятом человеке даже , сколько будет? Поэтому фактор скорости я упомянул.

                Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                • Gremlin
                  Gremlin @Васьвась отредактировано

                  @васьвась Вымотался нынче) Спать пойду. Надо насвежачка будет глянуть. Интересно там, наверное.

                  1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                  • Васьвась
                    Васьвась @Васьвась отредактировано

                    Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                    Поэтому фактор скорости я упомянул.

                    миллионы лет эволюции

                    В случае монотерапии ралтегравиром , вирусу потребуется пару месяцев эволюции чтобы вырастить броню к ралу.

                    Ilya Antipin 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                    • L
                      ladymusik63 @Васьвась отредактировано

                      @васьвась Ужас,что же делать?

                      Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                      • Васьвась
                        Васьвась @ladymusik63 отредактировано

                        Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                        что же делать?

                        Ничего. Ждать коронавирус ☠

                        1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                        • Ilya Antipin
                          Ilya Antipin Редактор @Васьвась отредактировано Ilya Antipin

                          @васьвась ну, и так же потеряет эти мутации, т.к. мутация дает выгоды только локальные, там, где есть комплект дурака и монотерапии ралтегравиром. А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато. Но, тут CAP-теорема в действии )

                          Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                          • Васьвась
                            Васьвась @Ilya Antipin отредактировано

                            Участник @ilya-antipin написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                            А вот если бы он мог его закрепить, сохраняя все свои параметры при том… было бы реально страшновато.

                            Ралтегравира мало. Пихают и будут пихать еще не один год ННИОТы наивным. Хотя к ним первичной резистентности хватает. Следом вылетают и НИОТы из такой схемы. А так как генотипирование делается редко и далеко не в каждом городе, то смена схемы происходит наобум и далее вылетают препараты других классов, оставшиеся один на один с вирусом. Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны, но схема эволюции ±такова .
                            Короче, Мурашко, давай готовь Фостемсавир и Трогарзо.

                            Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                            • Васьвась
                              Васьвась @Васьвась отредактировано

                              Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                              Масштабы первичной резистентности по регионам точно неизвестны

                              Но видимо начинают собирать данные. Меня на днях предупредили в сц, что вызовут взять кровь. Повезут ее в Новосибирск. Только нахрена им мой штамм 90-х годов рождения, да еще и с неопределяемой ВН - загадка.

                              S Ilya Antipin 2 ответов Последний ответ Ответить Цитировать 0
                              • S
                                Stuppy @Васьвась отредактировано

                                @васьвась Вектору денег на рисеч дали под короношумок?)

                                1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                • Васьвась
                                  Васьвась отредактировано

                                  Участник @stuppy написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                  денег на рисеч дали под короношумок?)

                                  Деньги , выделенные на анализ моего биоматериала , уйдут в трубу похоже.

                                  1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                  • Ilya Antipin
                                    Ilya Antipin Редактор @Васьвась отредактировано

                                    @васьвась все там определяется, просто нужно праймерами «поиграть», т.е. чуть выйти за пределы того, что делает коммерческий сундук типичный.

                                    1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                    • Васьвась
                                      Васьвась отредактировано

                                      Тоже интересно:

                                      https://life4me.plus/ru/news/vich-i-insti-5894/

                                      L 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                      • Root
                                        Root отредактировано

                                        Я вот справно кушаю ral + 3tc + taf. Мне следовало бы задуматься о смене ral на что-нибудь другое?

                                        Васьвась 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                        • Васьвась
                                          Васьвась @Root отредактировано

                                          Участник @root написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                          ral + 3tc + taf.

                                          3 препарата × 2 раза в день. А можно 2 препарата × 1 раз в день.

                                          1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                          • L
                                            ladymusik63 @Васьвась отредактировано

                                            Это сообщение удалено!
                                            Васьвась Ilya Antipin 2 ответов Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                            • Васьвась
                                              Васьвась @ladymusik63 отредактировано

                                              Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                              нельзя вместе с терой принимать магний ,цинк и все, что связано с металлами

                                              Тогда ты умрешь. Хотя с водой тоже металлы заносятся. Значит надо отказаться от воды тоже . А в воздухе - свинец и другой ужас. Все, приплыли 🤷‍♂️

                                              Нет. Все не так. Одновременно кое-что нельзя принимать. Но по другой причине, указанной в инструкции.

                                              L Васьвась 2 ответов Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                              • L
                                                ladymusik63 @Васьвась отредактировано

                                                @васьвась Действительно, без металлов никак. А вот интересно ,эта устойчивость наблюдалась в лабораториях, но в жизни пока нет? Это пока предупреждалка, но по каким то причинам может им. место. Но как предупредить это неизвестно по той причине,что неизбежно(((((

                                                1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                • Васьвась
                                                  Васьвась @Васьвась отредактировано

                                                  Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                                  Нет. Все не так.

                                                  1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                  • Ilya Antipin
                                                    Ilya Antipin Редактор @ladymusik63 отредактировано

                                                    @ladymusik63 вы путаете тонкие внутриклеточные процессы с процессами вообще другого уровня и других действующих лиц даже.

                                                    L 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                    • L
                                                      ladymusik63 @Ilya Antipin отредактировано

                                                      @ilya-antipin Спасибо, потому и спрашиваю, поскольку не биомедик.

                                                      1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                      • Gremlin
                                                        Gremlin @Васьвась отредактировано

                                                        Участник @васьвась написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                                        как это неживое, безмозглое существо делает такие продуманные ходы?
                                                        Ощущение, что это какой-то искусственный сверхинтеллект.

                                                        Из того, что нам было известно до этого исследования:

                                                        1. Интеграза ВИЧ использует для связи с ДНК человека ионы металла (преимущественно ионы магния).
                                                        2. Для образования координационных связей с двумя ионами металла интеграза ВИЧ задействует в своем составе активный сайт в виде DDE-мотива (2-е аспарагиновых кислоты и 1 глутаминовая).
                                                        3. Для образования связи с ДНК человека интеграза в комплексе с двумя ионами металла атакует этими ионами фосфодиэфирные связи ДНК человека и получаем единый координационный хелатный комплекс.
                                                        4. Обе вышеописанные реакции осуществляются с участием молекул воды (с применением гидролиза).
                                                        5. ИИ (ингибитор интегразы) связывается с интегразой также через ионы металлов (указанные в п.2), блокируя тем самым связь интегразы с ДНК человека (попутно галогенбензильным кольцом, связывая еще и вирусную ДНК).
                                                        6. Связь ИИ с ионами металла также происходит с применением реакции гидролиза (т.е. тоже с участием молекул воды).
                                                        7. При развитии резистентности к ИИ мутантная интеграза по какой-то причине предпочитает связываться через ионы металлов не с ИИ, а с ДНК человека.

                                                        Из того, что ученым стало известно после этого исследования:
                                                        А) Ученые, используя криоэлектронную микроскопию, смогли визуализировать точную структуру активного сайта интегразы, где происходит связь с ионами металла и следовательно с ИИ.
                                                        Б) Ученые смогли увидеть механизм взаимодействия интегразы с ионами металла и ИИ.
                                                        В) Ученые узрели, что ВИЧ изменяет химическую среду в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, связанных с интегразой и это ослабляет прочные связи ИИ с интегразой. И это трещина в броне ИИ. (Слова руководителя группы ученых данного исследования Петра Черепанова).
                                                        Г) Ослабление связывания ИИ происходит из-за комбинированного эффекта мутаций и потери ключевых молекул воды в активном сайте. (Слова одной из ученых в данной группе исследования Эдины Росты).

                                                        Теперь подытожим:
                                                        I. По сути, новое в данном исследовании, по сравнению с тем, что мы знали – это визуализация некоего механизма взаимодействия интегразы с ИИ, который МОЖЕТ приводить к резистентности. (Хочется надеяться, что непосредственно в статье в таком авторитетном журнале, как Science, они описали этот механизм конкретно и детально.) И то, что интеграза ослабляет связи с ионами металла в результате «обезвоживания» в активном центре ИИ.
                                                        II. Согласно п.7, по возникновению резистентности в результате мутаций интегразы, в принципе, мне кажется, многие и до этого исследования считали (т.к. вариантов здесь не особо много), что это происходит за счет увеличения по какой-то причине константы диссоциации хелатного комплекса ИИ с одной стороны, и интегразы, связанной с ионами металла, с другой стороны, по сравнению с константой диссоциации интасома ВИЧ + ДНК клетки человека (т.е., иными словами, то же, что сказал об этом исследовании в п.В Петр Черепанов).
                                                        III. Теперь остается понять потеря таких важных для ингибирования, да и интегрирования (следует из п.4 и п.6) молекул воды вблизи активного центра ИИ происходит вследствие мутаций интегразы, либо независимо от наличия мутаций интегразы всегда идет параллельным курсом и усиливается, благодаря эволюции ВИЧ, за счет привлечения каких-то иных сил (белков там ВИЧ, например и др.), но без мутаций интегразы этой потери воды пока недостаточно для развития резистентности? Т.к., исходя из формулировок п. Г и п.В это осталось неясным. Но, лично у меня, исходя из этого краткого обзора исследования получилось так:
                                                        • из п.В следует, что развитие резистентности к ИИ (= потеря брони ИИ) может происходить вследствие ослабления связи ИИ с интегразой;
                                                        • из п.В следует, что ослабление связи ИИ с интегразой происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов;
                                                        • из п. Г следует, что изменение химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов заключается в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ;
                                                        • из житейского опыта следует, что развитие резистентности к ИИ, как правило, сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы;
                                                        • таким образом, получается следующая цепочка: развитие резистентности вызвано ослаблением связи ИИ с интегразой, которое происходит за счет изменения химической среды в районе взаимодействия ИИ с ионами металлов, которое проявляется в потере ключевых молекул воды в активном сайте ИИ. А т.к. развитие резистентности сопровождается выявлением мутаций в гене интегразы, то получается, что мутация в интегразе вызывает потерю ключевых молекул воды в активном сайте ИИ, что в конечном итоге МОЖЕТ приводить к резистентности.
                                                        P.S. на самом деле очень интересно было бы узнать какой именно физико-химический механизм вызывает потерю молекул воды в активном сайте ИИ.

                                                        L 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 3
                                                        • L
                                                          ladymusik63 @Gremlin отредактировано

                                                          @gremlin Честь вам и хвала,но чем больше текста тем дальше до понимания сути вопроса…

                                                          Gremlin 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                          • Gremlin
                                                            Gremlin @ladymusik63 отредактировано

                                                            @ladymusik63 Честное слово, чем сильнее стараюсь написать покороче, тем выходит длиннее)

                                                            L 1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                            • L
                                                              ladymusik63 @Gremlin отредактировано

                                                              @gremlin А вы пишите на черновике, а сюда только последнее предложение)))))

                                                              Ilya Antipin Gremlin 2 ответов Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                              • Ilya Antipin
                                                                Ilya Antipin Редактор @ladymusik63 отредактировано

                                                                @ladymusik63 именно так и можно отличать глупости и теории заговора. Если что-то сложнее кукиша объясняется парой фраз – точно врут. Даже очень несложные процессы, вроде тех, что выше, требуют весьма развесистого описания, что и говорить о сложных процессах.

                                                                1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                                • Gremlin
                                                                  Gremlin @ladymusik63 отредактировано

                                                                  Участник @ladymusik63 написал в Ученые описали механизм развития устойчивости ВИЧ к ИИ:

                                                                  А вы пишите на черновике, а сюда только последнее предложение)))))

                                                                  Так и делаю, поверьте))

                                                                  1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                                  • L
                                                                    ladymusik63 отредактировано Ilya Antipin

                                                                    Не знаю куда адресовать,ну вот в эту тему ,может Илья исправит https://life4me.plus/ru/news/ingibitoryi-integrazyi-7615/ -интересная ссылка там внизу по ИИ- там и про набор веса и про многое

                                                                    1 ответ Последний ответ Ответить Цитировать 0
                                                                    • 1 / 1
                                                                    • Первое сообщение
                                                                      Последнее сообщение
                                                                    Пока вы нас поддерживаете – мы существуем.

                                                                    Лучшая помощь – регулярная автоматическая ежемесячная поддержка. Регулярная поддержка От 100 рублей в месяц. Легко отменить, если передумаете.

                                                                    Разовые донаты мы также очень ценим!    Поддержать разово    Просто и безопасно, переведя донат с банковской карты или телефона.

                                                                    Спасибо! Возникли вопросы – напишите [email protected].
                                                                    Если заметили ошибку на форуме – пишите в эту тему или на [email protected].
                                                                    © 2018 – 2021 HIV.PLUS Миссия Команда Соглашение об использовании