Распространенность ВИЧ в РФ оценили с помощью российских и зарубежных тест-систем



  • Ученые ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Института Пастера в Санкт-Петербурге, Центра стратегического планирования ФМБА России в сотрудничестве с представителем компании Abbott провели масштабное исследование ВИЧ-инфекции в общей российской популяции и группах высокого риска. В этой работе они сравнили характеристики тест-систем иммуноферментного анализа четвертого поколения от Abbott, Bio-Rad, а также трех российских производителей.

    Подробнее:

    https://pcr.news/novosti/rasprostranennost-vich-v-rf-otsenili-s-pomoshchyu-rossiyskikh-i-zarubezhnykh-test-sistem/


  • Редактор

    0_1611339885726_11f209f1-a3f0-4b52-862d-b561495a4607-image.png

    Все более или менее ок. ВИЧ-1,2-АГ/АТ (ООО «Медико-биологический союз») один раз зевнула, что не фатально, скорее всего, но при наличии альтернатив, лучше в случаях попыток ранней диагностики, до 4 недель, наверное, ее стоит избегать.

    Ну, и выявленный процент под 4% напрягает сильно. Очень надеюсь, что это особенности выборки.

    ВИЧ-положительными оказались 217 человек (3,99%)

    В исследовании участвовали 4452 представителя общей популяции, 391 человек из групп высокого риска ВИЧ-инфекции

    В общей популяции обнаружили 18 инфицированных (0,4%), причем распространенность ВИЧ была выше у мужчин по сравнению с женщинами (0,62% против 0,17%) и существенно выше — среди лиц младше 40 лет по сравнению с более старшими возрастными группами (0,58% против 0,05%).

    Однако в группах высокого риска распространенность оказалась выше почти на два порядка: среди пациентов кожно-венерологических центров — 34,1%, среди потребителей инъекционных наркотиков — 58,8%. Доля недавно инфицированных среди ВИЧ-положительных представителей общей популяции — 20%, в группе высокого риска — 4,2%.

    Тут есть над чем подумать. И, я бы сказал, что это очень качественные данные, которые позволяют несколько скорректировать понимание реальной распространенности ВИЧ в РФ. На основании прошлых данных, хотя это прикидки, я как-то представлял себе картинку как миллион ходит выявленный, еще полмиллиона – в тени. Похоже, что все заметно хуже. В Вилке 0,5-1 млн скрытая часть айсберга только в генеральной популяции, очищенной от факторов риска. Дальше сложно оценить субпопуляцию с высоким риском, так, как он сформулирован тут даже, но сложно допустить, что она менее 5 миллионов. Точнее, тут просто пальцем в небо. Окажется, что 10 млн – тоже не удивлюсь. Короче, белые пятна тут огромные, и никаких попыток (вот, за редким исключением) понять общую картинку точно по стране, по понятным причинам. И что за пределами агломераций… тоже все в тумане.

    D. E. Kireev и др. Serological diagnosis and prevalence of HIV-1 infection in Russian metropolitan areas. BMC Infectious Diseases volume 21, Article number: 24 (2021)..



  • @ilya-antipin спасибо за оперативный комментарий по этой работе.

    Меня здесь смущают данные по чувствительности разных тест-систем.

    С одной стороны все очень даже хорошо - при тестировании популяции true positives совпали между разными тест-системами (за исключением одного кейса, где и другие тест-системы дали слабые сигналы - что похоже на недавнее заражение).

    С другой же стороны чувствительность тест-систем очень сильно отличается для различных штаммов вируса, ряд систем здесь показал совсем удручающие результаты (чувствительность падала до 50%).

    Тут же авторы пишут, что в РФ как и в других странах все большее распространение получают различные штаммы вируса и их рекомбенанты, приводят их подтипы.

    Как тогда первые данные бьются со вторыми? В выборку популяции не попали неуловимые штаммы?



  • @авб неуловимые это те, которые у тебя якобы?



  • @ilya-antipin

    В качестве выявленных в России указывают вот эти подвиды:

    In early 2000s, HIV-1 subtype A, currently classified as subtype A6, was responsible for > 90% new infections. As of now, it is spread among > 80% of HIV-infected people. Subtype B HIV-1 is found in approximately 8% patients. Less common are subtypes G, C, D, recombinant forms CRF01_AE, CRF02_AG, CRF06_cpx, CRF11_cpx, CRF63_02A1, and AB-recombinants.

    Но не указывают на какие именно штаммы российские тест-системы не сработали на virus diversity panels.


  • Редактор

    @авб вы ставите вопросы, ответов на которые нет тут. Они не лишены смысла, но есть ли у них актуальность реальная? Может быть, но очень маловероятно.

    Давайте визуализируем ваши опасения. На уровне «норм» и «может и не норм». Со всеми понятными ограничениями, ну, как есть.

    0_1611353272612_7f46768a-ab8b-45bb-ada9-28bd7e331371-image.png

    Какое знание тут нам приходит? Ну, отечественные системы… отечественные. Есть ли тут именно проблема в в общей картине? Сильно не уверен. В каком-то частном случае? Маловероятно, но, возможно, что не невозможно. Как-то так.



  • @ilya-antipin спасибо за табличку, я ее сразу не увидел в публикации.

    Ну вот здесь как раз и понятно, что где то есть проблема в этом исследовании.

    Смотря на самый правый столбец, мы заключаем, что чувствительность тест-системы MBU более менее одинакова для всех штаммов вируса и их рекомбинантов. Интегральная чувствительность по этой панели 37 из 71.

    Интегральная же чувствительность той же тест-системы по популяции - это 216 из 217.

    Вопрос: какая статистическая вероятность того, что беря два разных достаточно больших пула положительных образцов, 71 и 217, в первом случае вы потеряете целых 34, а во втором - только 1? Ответ: статистическая вероятность практически нулевая. То есть здесь есть какой-то неучтённый системный фактор или факторы.

    Значит что-то не так в методологии исследования, и просто нельзя сопоставлять данные по панели с данными по популяции. Ну например, образцы из панели могли быть сильно разбавлены и поэтому концентрация антител в них была гораздо ниже чем у образцов из популяции?


  • Редактор

    Участник @авб написал в Распространенность ВИЧ в РФ оценили с помощью российских и зарубежных тест-систем:

    Ну вот здесь как раз и понятно, что где то есть проблема в этом исследовании.

    Мало панелей применено. Но цель исследования другая была. С панелями просто побаловались, можно сказать.

    Вопрос: какая статистическая вероятность того, что беря два разных достаточно больших пула положительных образцов, 71 и 217, в первом случае вы потеряете целых 34, а во втором - только 1? Ответ: статистическая вероятность практически нулевая. То есть здесь есть какой-то неучтённый системный фактор или факторы.

    А кто сказал, что у нас гетерогенная популяция по искомым признакам? Она как раз более или менее однородная должна быть в рамках одной связанной социально и экономически территории. Потому – все логично.

    Значит что-то не так в методологии исследования, и просто нельзя сопоставлять данные по панели с данными по популяции.

    Ясен веник нельзя, достаточно посмотреть на карту мира с доминирующими вариантами. В исследовании и не делали никаких выводов в ту сторону особых.

    0_1611357823794_a6db4b87-7ce2-4586-98e1-35aa010cefd1-image.png

    У нас тут А и рекомбинашки на тему А рулят. На самом деле у нас нет толковых этпидданных, кстати. Это по очень таксебешным замерам.

    Короче, для параноиков – Abbott или Bioarad. ВекторБест тоже пойдет, но уже людям с устойчивой психикой. Как-то так.



  • Участник @ilya-antipin написал в Распространенность ВИЧ в РФ оценили с помощью российских и зарубежных тест-систем:

    Короче, для параноиков

    И этого мало будет. У них супер-экстра-мега-инопланетный рекомбинант. Под который еще не создано диагностических систем.


 

Нам нужна ваша поддержка!
Кратко – мы существуем только потому, что вы нам помогаете и пока вы нам помогаете.

Как поддержать проект? Любая банковская карта, или баланс телефона, нажать на кнопку, а дальше все просто – Яндекс.Деньги все подскажут: А еще есть опция оформить автоматический ежемесячный донат от 100 рублей (передумаете – можно легко отключить): Спасибо! Возникли вопросы – напишите [email protected]. И еще....
Где мои уведомления на email?
Уведомления нужно перенастроить в профиле пользователя. Как именно – написано здесь. Если что-то не выходит или не ясно, то напишите на почту [email protected] с того email, который использовали при регистрации.