ВИЧ, спрятанный в клетках пациентов, теперь можно точно измерить

[Васьвась]

Теперь исследователи могут быстро и точно подсчитать скрытую, неактивную форму вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), который скрывается в клетках пациентов. Эта версия ВИЧ внедряется в геномы клеток и может сохраняться, несмотря на успешные в других случаях методы лечения , препятствуя попыткам вылечить инфекцию.

Используя новую генетическую технику, разработанную исследователем Медицинского института Говарда Хьюза Робертом Силиджано и его коллегами, исследователи, наконец, смогут измерить, сколько именно этой вирусной формы прячется в организме - важная часть оценки эффективности новых методов лечения, говорит Силиано. ,

Предыдущие инструменты переоценили количество этой формы ВИЧ в 10-100 раз, потенциально скрывая значимые снижения, вызванные экспериментальной терапией, согласно отчету его команды в журнале Nature от 30 января 2019 года. «Возможно, нам еще далеко из лекарства, - говорит он, - но теперь, по крайней мере, мы можем измерить наш прогресс ».

Подробнее:

https://www.nature.com/articles/s41586-019-0898-8

[Ilya Antipin]

@васьвась не только переоценивали, но и недооценивали. Есть много методик оценки провирусной ДНК. Стандартные ПЦР-тесты используют короткие субгеномные ампликоны в консервативных
регионах, что не дает представления о целостности провируса, а также о фатальности для репликации имеющихся замен или повреждений.

Проще: основная проблема там была, да и есть, в том, что нужно учесть долю «битых» копий провирусов, а также в условиях где более одной интеграции на геном.

Consistent with previous reports, only 2.4% of proviruses
were intact. The remaining 97.6% had fatal defects including deletions, encompassing on average 49.6% of the genome, and/or G→A hypermutation, which altered start codons and/or introduced stop codons in most open-reading frames (ORFs).

Из той же статьи.

Ну, и нужно понимать, что методика не будет применяться в клинических условиях, а лишь в КИ, и то, скорее, чтобы понять границы и пределы, а далее пользоваться более дешевыми методами + экстраполяция.

Предложенная методика сильно точнее, но не идеальна также.