В терапии состояний, вызванных выраженными иммунодефицитами, включая СПИД, крайне важна скорость диагностики. Особенной проблемой является сепсис, где каждый час отсрочки антибиотикотерапии при сепсисе повышает риск смертности на 6-8%. Эмпирическое назначение антибиотиков, основанное на клинической картине, региональных эпидемиологических данных и ситуации в стационаре, а также прочих косвенных знаниях, значительно менее эффективно, чем этиотропное назначение антибиотиков, когда известен не только возбудитель, но и определена чувствительность к антибиотикам данного конкретного возбудителя из очага инфекции.