Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке
-
Добрый день!
Кто может рассказать про анализ на резистентность при нагрузке в менее 50 копий!?
Кто и где делал, и ваши отзывы?
-
Добрый день!
Кто может рассказать про анализ на резистентность при нагрузке в менее 50 копий!?
Кто и где делал, и ваши отзывы?
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
Кто и где делал
В @H-Clinic делают.
-
@васьвась в сравнении с обычным анализом на резистентность, на сколько достоверен этот(менее 50 копий) анализ?
Не деньги ли на ветер?
Спасибо
-
Участник @васьвась написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
В @H-Clinic делают.
Васьвась не делает. Надо у них спросить.
-
@васьвась они с смд работают, смд не делает. Вообще в России такого анализа нет. Только от 1000 копий, около 30-35тр за все будет
-
@настя2019 Что такое СДМ и СМД?
Расшифруйте, плиз, аббревиатуры…
Спасибо
-
@mimi https://www.cmd-online.ru/ смд конечно, даже не заметила, что буквы перепутала… Сори)
-
@настя2019 В этом центре, как мне сказали, делают тест от 150 копий.
-
@mimi кто сказал? Впервые слышу. У них даже на сайте стоит, что от 1000 копий. Буквально девочка в том месяце сдавала, прислали ответ, что копией не хватило, приходите за возвратом денег.
Даже сходила посмотрела с ней переписку 28.06. Она сдавала. Надо было 1000 копий на тест
-
@mimi 032106 - Определение резистентности ВИЧ к ингибиторам протеазы и обратной транскриптазы (Услуга оформляется только дозаказом к услуге 032102 в течение 14 к.д. от даты регистрации услуги 032102, если вирусная нагрузка составила более 1000 копий/мл. Для этого укажите дату регистрации и номер пробы, под которым биоматериал был зарегистрирован в CMD)
С сайта https://www.cmd-online.ru/analizy-i-tseny/opredelenije-rezistentnosti-vich-k-ingibitoram-proteazy-i-obratnoj-transkriptazy_032106/
-
@настя2019 Информацию выдала девушка по телефону(консультант), но позже меня связали с врачом и он подтвердил, что необходимо 1000 копий
-
Участник @васьвась написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
В @H-Clinic делают.
.
-
Участник @настя2019 написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
Вообще в России такого анализа нет.
То есть сотрудник клиники врёт - ваше заявление. У вас есть основание такое утверждать? И говорить за всю Россию?
-
@васьвась а с чего вы взяли что в клинике делается такой анализ? На сайте клиники анализа с такой нагрузкой нет. Я НЕ утверждаю что это не так, но не встречал ни в постах от них, ни в их рекламе. Было бы классно, если бы хоть кто-то в РФ наконец начал делать этот анализ. Интересно, кому они отдают на анализ?
@H-Clinic ?
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
в сравнении с обычным анализом на резистентность, на сколько достоверен этот(менее 50 копий) анализ?
Не деньги ли на ветер?Делаем не мы, а лаборатория, в которой ведётся НИР по этому направлению. Предупреждаю сразу, анализ пока экспериментальный, но достоверность проверил лично.
На следующей неделе разработаем с руководством процедуру взаимодействия клиники и пациента по экспериментальным анализам. Отпишу здесь…
-
@h-clinic Добрый вечер! Вы подписываетесь " H клиник"! Вы представитель клиники, или пациент, или вместе взятое?!
В любом случае интересный анализ.
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
а с чего вы взяли что в клинике делается такой анализ?
С чего надо. Я вроде от балды ничего не пишу. Не заметили? И необязательно это публиковать на сайте. Даже нежелательно скорее.
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при вирусной нагрузки менее 50 копии:
но не встречал ни в постах от них
А я встречал. На юхиве.
-
@васьвась замечательно! Но достаточно было просто ответить " из лично общения с сотрудниками клиники" или "было на…"
Вот грубить вообще не обязательно.
Я понимаю, вас в последнее время донимали без повода, но я в этом не участвовал и не причем.
-
@васьвась, @h-clinic замечательная новость, большое спасибо от всех и от меня лично за информацию!
Это и правда видимо впервые в РФ, да и за рубежом не много мест где делают при не определяемой.
Никогда не понимал почему у нас не занимали эту нишу- возможности были и есть покрайней мере у нескольких фирм. Конечно тут есть определенные вопросы к достоверности, но под вывеской экспериментальных или НИР давно могли.
Замечательно что кто-то решился!
-
Генотипирование реально сделать на существующих коммерческих системах от ВН 400-600, но вероятность успеха очень невысокая, бывает, что и при более низкой ВН удается, но это уже казуистика для текущих систем. Более или менее хорошая вероятность от 600-800 копий, и очень неплохая вероятность успеха от 1000 копий, но, опять же не 100%, кстати. И речь тут идет о РНК ВИЧ.
Но у нас есть интегрированная ДНК, и вот с ней можно работать при любой ВН. Сейчас генотипирование по ДНК в США довольно рутинная штука, но, доступность и там не везде идеальная. У нас гораздо сложнее, но, выше указали, что и тут уже можно, осваивают. По идее, если стремиться соответствовать гайдам современным, то генотипирование по провирусной ДНК должно быть доступно в любом центре СПИД.
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
грубить вообще не обязательно.
Ни одного грубого слова. Люди какие-то ранимые и мнительные стали. А вот когда мои слова под сомнения ставят - не очень приятно. Крч проехали.
-
@васьвась да, врет, выше об этом даже написали, что дали потом доктора и тот сказал, что девушка ошиблась. У вас опять ПМС? Нельзя ж кидаться на всех на пустом месте.
-
Участник @настя2019 написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
да, врет
В чем именно?
-
Участник @настя2019 написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
У вас опять ПМС?
Оч смешно. Вы сестра-близнец Петросяна? Без повода и причины я никому ничего не говорю. А вы соврали дважды. Сначала про сотрудника h-clinic, потом, что на вас кто-то “кидается”. Это или паранойя или галлюцинации. Выздоравливайте там.
-
@васьвась я ж написала. Уж прости, ругаться вообще не хочу. Никакого желания из пустоты бурю делать. Есть инфа, что кто то делает на низких копиях, рады будем почитать, а может и сделать.
-
Участник @настя2019 написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Вообще в России такого анализа нет
Даже трижды соврали.
-
@васьвась вы б к Илье на приём сходили, чес слова…
-
Участник @васьвась написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Вообще в России такого анализа нет
Формально – нет. Коммерческой услуги такой нет. А технически возможно, грубо – если можно секвенировать ДНК, а это можно и дома уже сделать, если тысяч сто долларов завалялась, то можно и получить и генотипирование провируса ВИЧ, однако, это практически ручками и индивидуально фактически, тогда как все же стоит говорить о том, что это «есть», когда есть лаба, сеть, и строчка в прайсе.
-
@ilya-antipin не думаю что будет именно в СЦ, ну не при моей жизни уж точно. Во первых это NGS, во вторых тут нужны высококвалифицированные кадры и вычислительные мощности. Да и в каждом прям СЦ, имхо не нудно- не загрузится ( а такая техника должна работать по полной, иначе это забивание гвоздей микроскопом).
Всё это решаемо если делать на базе субъектов РФ и собирать туда пробы централизовано…но тогда это нужно создать, поддерживать, стандартизировать, авторизировать… И ведь тут не смухлюешь с импортозамещением реактивов, не обманешь работника (легко найдет другое место), и для кого- для этих, которые на перебои жалуются? Нет, в реалиях нашего Минздрава это не реально. А вот частные клиники, комерческие фирмы активно работающие на NGS с наукой и т.д. - это да. Я в Москве знаю три таких, про которые поверю - вполне смогут если захотят.
Странно что раньше не было, замечательно что наверное появятся!
-
@alexm нет, я не говорю, что исполнение должно быть на уровне СЦ, естественно. Отработанная логистика, и организационные вопросы, а исполнение вряд ли стоит делать более чем в двух местах на страну. Скажем, Владивосток или Хабаровск и МСК.
-
Участник @ilya-antipin написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Формально – нет.
В прайсах лаб не стоит. Но пациенту не важно - что и у кого стоит. Исследование такое есть.
-
@васьвась вы не понимаете, чем отличается серийный автомобиль от собранного в гараже? Это очень не одно и то же.
Условно, завтра те умельцы из гаража будут заняты своей тематикой, и все, ничего они не будут секвенить на сторону. Просто занят будет гараж, и те 2,5 чувака, что могут в это в РФ.
-
Участник @ilya-antipin написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Условно, завтра те умельцы из гаража будут заняты своей тематикой, и все, ничего они не будут секвенить на сторону.
Не знаю что будет завтра-через год-10 лет. Я пишу о том, что есть сейчас. Без прогнозов и комментариев.
И надеюсь в будущем, если заинтересовать, замотивировать специалистов, то будут.
-
@ilya-antipin
Ограниченное предложение десятилетия! Только в этом сезоне!
После выполнения НИР наш Михаил приступит к написанию диссера и ему будет не до Вас, - спешите!
))
-
Участник @васьвась написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
И надеюсь в будущем, если заинтересовать, замотивировать специалистов, то будут.
Вы не очень понимаете то, о чем пытаетесь судить. Ничем вы не мотивируете научную лабу заниматься рутинным коммерческим сервисом на потоке. Или она перестанет быть научной лабой. Одно из двух.
Пока никто из коммерческих сетей не освоит соответствующие технологии, то это все из области «как повезет». Если вам купили секвенатор за кучу бабла, и на нем возможно делать и это, это не значит, что там в принципе достижима приемлемая цена, это раз
А специализированное заточенное оборудование ViroSeq HIV-1 Эбботовский или TruGene HIV-1 Сименсовский у кого есть? А вот Ion Torrent какой использовать для этого… ну, можно, разок, десяток раз, и потом по башке настучат. Ну, или кто оплатит этот банкет?
-
Участник @ilya-antipin написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Просто занят будет гараж, и те 2,5 чувака, что могут в это в РФ.
Занят 24/7 ? 365 дней в году? Не думаю. СЦ оказывают платные услуги. Например. Хотя народу в них обращается куда больше.
-
Уважаемые Илья и ВасьВась, хочется для народа,по простому услышать от вас “за” и “против” по данному анализу))!
Найдите, плиз, время для форумчан!)
Спасибо.
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
“за” и “против” по данному анализу))!
Большинству он не нужен. Нужны показания.
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Добрый вечер! Вы подписываетесь " H клиник"! Вы представитель клиники, или пациент, или вместе взятое?!
Добрый вечер! Вместе взятое))
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Это и правда видимо впервые в РФ, да и за рубежом не много мест где делают при не определяемой.
Никогда не понимал почему у нас не занимали эту нишу- возможности были и есть покрайней мере у нескольких фирм. Конечно тут есть определенные вопросы к достоверности, но под вывеской экспериментальных или НИР давно могли.
Замечательно что кто-то решился!К достоверности вопросов уже нет. Технология позволяет извлекать провирусную ДНК и использовать в тех же тест-системах, что и РНК.
Предварительно проработали с лабораторией вопрос их производственных мощностей. Пока они готовы делать до 20 анализов в месяц. Если анализ окажется востребован, то мощность может быть увеличена и есть перспектива перевести этот анализ в разряд коммерческих…
-
Участник @h-clinic написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
до 20 анализов в месяц. Если анализ окажется востребован, то мощность может быть увеличена и есть перспектива перевести этот анализ в разряд коммерческих
@Ilya-Antipin , а вы сомневались)
-
Участник @ilya-antipin написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Ничем вы не мотивируете научную лабу заниматься рутинным коммерческим сервисом на потоке.
Н-сlinic чем-то замотивировала)
-
Участник @васьвась написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Занят 24/7 ? 365 дней в году?
У вас нет знакомых из НИИ? Поговорите. Вы просто не понимаете предмета и устройства в этих сферах. В ночные смены в НИИ обычно не выходят, и в выходные тоже. А в рабочее – да, оборудование будет занятно и должно быть занято. В любом случае, даже если на нем что-то не делают, это не значит, что там есть свободные люди, значит они чем-то занимаются в этот момент на другом оборудовании. Или курят и думают. Не важно. Сейчас кому-то в МСК интересно погенотипировать из ДНК, завтра материал будет собран, работа написана и все. Если речь идет о ЦНИИ эпидемиологии, там чуть иная история, и они действительно могут долго держать какой-то объем, но вот какова будет коммерческая цена… если будет, впрочем, я уверен, что спрос будет очень небольшой и вряд ли тут дело дойдет в обозримом.
-
@mimi подсмотреть мутации из ДНК?
Это нужно, скажем, если вы были на Калетре и хотите на дарунавир с ритонавиром в варианте 800+100 однократно. Или, если ВН стабильно выше желаемых, скачет, скажем в районе 200-600, и ясно, что что-то выбито, а отменять не хочется. Или же, если вы хотите применить препарат, где в показаниях условие назначения – генотипирование в базе, а вы уже на терапии. Больше ситуаций придумать не могу.
-
@ilya-antipin вот прям истину глаголите!))
-
@h-clinic под “достоверностью” я понимал совсем вообще ни разу не это. Я про достоверность такого способа вообще.
-
@alexm то что технология позволяет - ясен пень. Я о том, что нигде не видел сколько нибудь серьезных исследований по представленности, структуре и разнообразию резервуаров. А также по клинической значимости этих значений для дальнейшей терапии.
@ilya-antipin, поправьте, плиз, если в курсе.Вот Вы взяли пробу крови и выделели что-то. Были исследования что какие именно типы клеток нужны - мононуклеары как при стандартном анализе результатов на ДНК ВИЧ или лучше другое? Ну ок, вы суммарную выделели. А что у нас с резервуарами в лимфосистеме кишечника и в прочих лимфоузлах организма? Были исследования с большой выборкой и множественным отбором биопсий? Там генотип резервуаров везде идентичен? А что у нас с резервуарами в нервной системе? Там были исследования по идентичности резервуаров с биопсиями? А были исследования категории А что подобные исследования можно точно принимать как критерий отсутствия резистентности в резервуарах?
На самом деле, я конечно понимаю, что и сам бы заказал такой анализ, если б по цене мне приемлемо и переходил на что-то новое в сокращённой схеме. Просто потому что могу финансово позволить себе перебдеть и это меня чуть успокоит. И на самом деле и там фирмы роют в этом направлении - у меня в начале КИ по пролонгам официально брали на NGS. Поэтому появление подобного в РФ тока приветствую! Но нужно понимать, что это все пока экспериментально и не сертифицированно.
-
@ilya-antipin Схема:тивикай, теновафир, лам!
На данной терапии 3 месяца.(ранее терапии не было)
До приема тары :Клеток 590, 25%,сд4/8-0.45, нагрузка 3800
июнь 2019: Нагрузка менее 20,клетки 780,29%,сд 4/8-0.65
Август 2019:Нагрузка менее 20,
клеток 640,27%, сд4/8-0.49
Врач предлагает убрать теновафир.
Ранее вы мне написали, что переход возможен.
Немного опасаюсь, при том, что клетки и % не стабильны.
Вот и думаю сделать тест на резистентность.
Или в данной ситуации он(тест) погоды не сделает?
Спасибо.
-
@mimi Вы не туда думаете. Нагрузки нет - терапия работает, не надо делать тест. И процент у вас колеблется незначительно, всё норм, забейте. Занимайтесь зожем, болячки какие есть другие хронические - лечите, чтоб подрос
-
Всем спасибо за ответы. Желаю здоровья
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Были исследования с большой выборкой и множественным отбором биопсий?
Нет, опасно и дорого. Только трупный материал тут, а это не очень интересно. Ничего из того, о чем вы серьезного не видел. Т.е. более или менее понятно, что в ЦНС виря до пса, любит он, но репликации мало, однако и белки вируса цитотоксичны, и мезоглю злить не стоит. Лимфоидная ткань кишечника – alma mater ВИЧ…
Штука в том, что резервуары формируются очень-очень рано и более или менее статичны, как мы сейчас понимаем, т.е. ковырять их смысла нет, найдешь в итоге дикий тип, тогда как в мононуклеарчиках будет как раз партактив, а значит с рабочими мутациями устойчивости, если таковые есть.
Если я правильно понял, о чем вы.
-
@mimi у вас все круто. Если вам не переходить на двойную схему, то кому тогда?
-
@ilya-antipin да, в принципе правильно)
То есть на трупном материале мы видим что резервуары во всех тканях более или менее статичны и одинаковые по генотипу и следовательно при прекращении активной репликации на АРВТ ( из соображений формальной логики и здравого смысла) они лишь ещё более законсервируются. А значит, если чего и смотреть, то только что-либо реплицирующее хоть как-то, то есть мононуклеары. И при этом (тоже из соображений логики) репликация в ЦНС, например, если она есть, идёт под той же селекцией, что и в крови - значит наверное тот же генотип. Ок, убедили))
А вот вроде в США подобный сервис тоже был. Что там слышно? У них все ок, результаты сиквенсов потом подтверждались на практике отсутствием проблем при переходе на новую терапию?
-
@alexm во всяком случае в гайде DHHS уже… две редакции как это дело фигурирует, а в последней генотипирование по ДНК впилили уже интонационно как рутинное, т.е. во всех непонятных ситуациях делаем и ориентируемся.
-
@ilya-antipin именно NGS при низкой нагрузке? Надо же, не знал!
Ну тогда наверное все норм, значит наверное нужный объем исследований был.
Замечательно, значит ждём когда и за сколько это будет у нас.
-
A next-generation sequencing genotypic resistance assay that analyzes HIV-1 proviral DNA in host cells is now commercially available. This test aims to detect archived resistance mutations in patients with HIV RNA below the limit of detection or with low-level viremia. C-14
A next-generation sequencing genotypic assay that analyzes HIV-1 proviral DNA may provide additional information on drug resistance in patients with low levels of plasma HIV RNA or in patients whose levels are below the limit of detection (CIII). However, these assays might miss some or all the previous drugresistance mutations, and they should be interpreted with caution. The usefulness of these assays in the clinic is still under investigation and has yet to be fully determined. C-15
The next-generation sequencing genotypic resistance assay that analyzes proviral DNA in host cells can be considered when conventional HIV RNA drug resistance testing is unsuccessful or unavailable for patients initiating therapy (CIII). As outlined above, the results should be interpreted with caution, as this assay might miss some or all previously existing drug-resistance mutations. C-16
The next-generation sequencing genotypic resistance assay that analyzes proviral DNA can be considered for patients who are experiencing treatment failure and for whom conventional HIV RNA genotypic drug-resistance
testing is unavailable or unsuccessful (CIII). As outlined above, results should be interpreted with caution, as these assays might miss some or all previously existing drug-resistance mutations.
…
The next-generation sequencing genotypic resistance assay that analyzes proviral DNA can be considered for these individuals, particularly if complex or semi-complex pre-existing resistance is suspected. In individuals
who have experienced no prior virologic failures and who are on their first or second regimen, or who have genotypic testing results from when they had prior virologic failures, the use of the proviral DNA genotypic test
is unlikely to provide additional useful information. However, in individuals who have experienced multiple prior failures, a prolonged history of prior ARV regimens, and/or for whom prior genotypic resistance test
results are not available, it may be appropriate to utilize proviral DNA genotypic testing (CIII). When such testing is obtained, results should be combined with all prior genotypic and phenotypic test results to construct a
cumulative genotype, which incorporates all current and previously detected drug-resistance mutations. Results from this test should be interpreted with caution, as these assays might miss some or all previously existing
drug-resistance mutations. The usefulness of these assays in the clinic is still under investigation and has yet to be fully determined. C-17Table 5. Recommendations for Using Drug-Resistance Assays (page 2 of 2) C-19
In patients with an undetectable viral load or detectable plasma HIV RNA <1,000 copies/mL, phenotypic co-receptor usage can be determined using proviral DNA obtained from peripheral blood mononuclear cells (e.g., Trofile® DNA, Monogram Sciences); however, the clinical utility of this assay remains to be determined. С-24
и так далее еще в ряде мест. Широко так ввели, и подробно довольно.
-
@ilya-antipin ну замечательно тогда. Проблема правда в том, что это все “приемлемо” по цене только на потоке, а так неподъемно. Да и на потоке то…не три копейки. Вот тут меня терзают смутные сомнения и одновременно нетерпение - скока ж у нас ценник выкатят?
Но повторюсь я за любой кипеж в доступности. Пусть и не воспользуюсь сам, но чтоб было.
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
скока ж у нас ценник выкатят?
Мой прогноз – нисколько. Если кто-то не исхитрится встроить это как-то в бизнес-процессы существующие, точнее, те, что будут существовать. А до того – не будет просто.
Ориентиры, впрочем, есть, если посмотреть на Китай или Индию – 300-400 долларов.
Более реально то, что мы пропустим один технологический шаг, и где-то лет через пять технология придет уже на качественно другом уровне, где себестоимость с высокой вероятностью упадет на порядок.
-
@ilya-antipin то есть где-то 23-25 тыс. руб. на сегодня. Ну да, похоже на цену этого на потоке. Но у нас должно получится в разы дороже, так как штучно.
Уже фактически. Если все пойдет как ожидается, то в конце этого года должны запустить в продажу Nanopore с качеством прочтений ридов не хуже чем у Illumina. Начиная с этого момента можно отсчитывать умирание Illumina как технологии NGS. И Nanopore уже сегодня по факту сильно дешевле. Правда там есть проблема доступа третьих стран к технологии из-за монополизма производителя - так что да, реально можем пропустить этот технологический шаг из-за санкций. Ну в смысле и этот и следующий шаги.
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Уже фактически. Если все пойдет как ожидается, то в конце этого года должны запустить в продажу Nanopore с качеством прочтений ридов не хуже чем у Illumina. Начиная с этого момента можно отсчитывать умирание Illumina как технологии NGS. И Nanopore уже сегодня по факту сильно дешевле.
Я тут очень поверхностно сужу, слегка приглядываю, но где-то видел прогноз недавно, что на порядок цена за единицу тут упасть может через 5 лет. Оценить качество аналитики не могу, и не пытался. Но, глядя назад… может быть вполне, не выглядит фантастично.
-
@ilya-antipin я вот ни разу не аналитик, не очень понимаю какие правила подсчёта тут.
Да и работаю не с человеком, а с микробами.Вот допустим у вас есть прибор/технология #1, которая позволяет вам прочесть миллион пар за 1000 попугаев. Но маленькими кусочками, поэтому у вас последовательность соберётся не одним целым а десятью фрагментами. Для большинства целей и этого достаточно. Но если прям вот очень, то можно воспользоваться другой технологией, #2, и прочитать большими кусками и собрать единым куском, но менее точно и за 10 000 попугаев. В реальности читают и тем и другим и потом компилируют.
Вдруг появляется технология #3 позволяющая читать очень длиными кусками, собирать в один фрагмент и за 1000 попугаев опять же. Но опять же не очень точно. Но в отличии от первого варианта тут можно взять числом - много раз прочитать и получить точно, но уже за 5000 попугаев.
Подведем промежуточный итог:
#1 + #2 = 11 000 попугаев
#3 = 5000 попугаев.
Но в большинстве случаев не нужно и хватает 1000попугаев.Вот и как тут считать улучшения?Теперь разработчики пару лет назад говорят: мы сможем сделать технологию #3 такой же точной как #1 и за теже деньги. И почти получилось. То есть блоху подковали, но вот в серию не смогли, никак. Новое обещание назначено на грядущий январь-февраль. Наверное смогут. Ну или смогут чуть позже. Что мы будем иметь тут? Тот же миллион пар за те же 1000 попугаев, но фрагментом, на сборку которого раньше затратили бы 11 000 попугаев. То есть для меня как ученого это архиважный скачок - можно собирать единым целым геномы, которые раньше собрать было невозможно (недавно анонсировали сборку генома пшеницы). Но ведь для большинства моих задач это не особо нужно то есть я как платил 1000, так и буду платить, просто получу ещё пироженку вдобавок. Пироженку очень вкусную и хочу-хочу, но вообще и обойтись могу. То есть падение цены на порядок вроде и произошло, а вроде и не совсем. Черт его знает как тут аналитики считают.
-
Важно ещё и то, что технологию #3 ( по динамике последних лет) производителю всегда удавалось ужимать в меньшем объеме и без серьезного повышения цены в пересчёте. То есть тут сейчас чип “на много” не на несколько порядков дороже чем маленький и в пересчёте на образец цена сильно падает.
Мне кажется вполне реальным тут в пределах пяти лет и повышение качества и повышение вместимости - тогда да, суммарно упадет на порядок в пересчёте на образец. Может и больше упадёт.
Но тут есть ограничение технологии пока не преодолимое - срок годности. Он не большой. То есть вы не можете заказать чип на сто ваших проб, сиквенировать десять и положить в холодильник - прокиснет. То есть точно должен быть поток. И применительно к теме обсуждения - не представляю этот поток в РФ. Разве что вот прям одна-две конторы на страну.
P.s. и опять же санкции - нам могут просто запретить покупку ячеек и усё
-
@h-clinic вот вдруг еще один вопрос всплыл в моем воспаленном выходными мозгу:
- исследование делается в сотрудничестве с CMD и (видимо) на базе CMD, так?
Вопрос: можно ли будет учесть эти суммы в дисконтной программе CMD (полностью или часть)?
- исследование делается в сотрудничестве с CMD и (видимо) на базе CMD, так?
-
@alexm нет, у эйч своя программа вообще, даже стандартный ОАК они не могут провести по цмдшному профилю. Более того, цмд - одна из самых активных лаб в мск, половина частных клиник к ним возит анализы, у клиник свои программы для пациентов, а цмд им дает общую агентскую скидку
-
@alexm а что вам мешает сдать эти анализы в цмд? Если с вашей скидкой там дешевле. Другой вопрос, что если вы про тесты на пороге НО, так они вроде не в цмд это делают. А с каким то институтом договорились.
-
@настя2019 его нет в прайсе “с улицы”
-
@настя2019 вот да, - нету((
-
@stuppy так он вроде и не цмд, от того и нет
-
@настя2019 кто не цмд, о чем вы? Есть НИИ Эпидемиологии, помимо прочего, головное учреждение по ВИЧ. У них есть крутая лаба. Они запустили в дополнение к ниишной истории на этой базе коммерческую - сеть cmd.
Часть врачей H-Clinic выходцы из этого НИИ, сотрудничают с ним. А само НИИ, естественно, ведет научную работу и может делать больше анализов и разных штук, чем интересных сообществу на потоке коммерческом
-
@настя2019 вроде CMD, но по договоренности с H.
Подождем что H ответит.
-
Участник @stuppy написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
НИИ Эпидемиологии, помимо прочего, головное учреждение по ВИЧ.
А не Федцентр Покровского - головное? Или что вы понимаете под термином “головное”?
-
@васьвась подразумевается, думаю, в плане параклиники. Т.е. ИФА и молекулярная диагностика, тут – да, они рулят.
-
@stuppy это вы о чем?! Смешались в кучу яйца люди…
-
Участник @alexm написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
исследование делается в сотрудничестве с CMD и (видимо) на базе CMD, так?
Вопрос: можно ли будет учесть эти суммы в дисконтной программе CMD (полностью или часть)?нет, это не CMD… если есть необходимость в анализе, обращайтесь, поможем сделать…
-
@h-clinic Как записаться и куда звонить?
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
@h-clinic Как записаться и куда звонить?
@MiMi, напишите мне на почту [email protected]
-
Эта запись удалена!
-
@h-clinic, написал вам на почту, а ответа нет от вас)
-
@h-clinic, аууууу… хочу с вашей помощью сдать анализ на резистентность при нагрузке менее 50 коп.!
Возможно ли ещё?
Спасибо
-
@mimi а позвонить в эту клинику не пробовали? В чем проблема-то?
-
@вячеслав, в клинике нет прейскуранта на эту услугу…
-
@mimi вы звонили? По телефону должны дать информацию.
-
17.000 анализ на ИП,НИОТ,ННИОТ.
17.500 анализ на ИИ.
Анализ на вирусную нагрузку сдавать не надо.
Связь через H-clinic.
-
Участник @вячеслав написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
По телефону должны дать информацию.
Нет.
-
С @MiMi договорились, всё нормально.
-
Участник @доктор-ливси написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
17.000 анализ на ИП,НИОТ,ННИОТ.
17.500 анализ на ИИ.
Анализ на вирусную нагрузку сдавать не надо.
Связь через H-clinic.Всё верно. [email protected]
-
@h-clinic, кстати… спасибо
-
Добрый вечер!
Если в семье оба партнёра вич позитивные, можно ли сдать тест на резистентность (при неопредяляемой нагрузке) только одному партнеру…
И соответственно, можно ли результаты этого анализа распространить на второго партнера?
-при одинаковой терапии у обоих
-при разной терапии у партнеров
Спасибо
-
@mimi если мы знаем кто источник, и знаем, что после передачи ВИЧ более ничего не происходило, т.е. не было АРВТ, например, то можно. Мутации будут идентичными или предельно близкими, отличаться в полиморфизме скорее. Не без всяких «но»… т.е. тут вопрос, когда приобретены мутации относительно времени теста. Дикий штамм довольно быстро вытеснит из плазмы мутанта, но мутант будет в резервуарах. Как-то так.
-
@ilya-antipin источник неизвестен.
Если есть разные “но” , то тогда лучше 2-м пройти тест на резистентность.
Спасибо
-
Добрый вечер!
Сделал анализ при неопределяемой нагрузке на резистентность…
Есть вот такая мутация V179T
Чем она опасна, если когда то будут назначена терапия в виде уколов!
Спасибо
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Есть вот такая мутация V179T
Чем она опасна, если когда то будут назначена терапия в виде уколов!
СпасибоРилпивирин возможно отпадает. Но одно дело, когда полно копий вируса в плазме с такой мутацией, другое - когда он дрыхнет в резервуарах 🤔 @Ilya-Antipin точнее скажет.
-
@васьвась А укольчики как раз с рилпивирином!?
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
А укольчики как раз с рилпивирином!?
Да. Редкая неполиморфная мутация , снижающая чувствительность ВИЧ к рилпивирину и этравирину. Но она у тебя в “архиве”. Теоретически если этот штамм просыпается, то рилпивирин может его не грохнуть, но каботегравир то замочит 🤔
-
@mimi V179T– слабая мутация устойчивости, которая накрывает все ННИОТы в той или иной мере. Скорее всего классический тройной режим на базе ННИОТ будет работать с данной мутацией. Единственное, что там интересно – наличие гомополимерной последовательности. ATAGTTATC. Что имеет значение в плане детекции, и то… скорее уже нет. Некоторые относят V179T к мутациям полиморфизма, например Hassan AS, Mwaringa SM, Obonyo CA. и др. Low prevalence of transmitted HIV type 1 drug resistance among antiretroviral-naive adults in a rural HIV clinic in Kenya. AIDS Res Hum Retroviruses. 2013 Jan;29(1):129-35. PMID: 22900472.
-
@ilya-antipin
да уж… темный лес!
Сейчас на схеме Долутегравир и ламивудин!
Правильно понимаю, что эта мутация здесь не мешает!!
А вот на укольчики будет негативно действовать!?
Или вероятность какая то остается, что укольчики могут подойти мне.
Спасибо.
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Правильно понимаю, что эта мутация здесь не мешает!!
Не мешает.
По укольчикам – когда выйдет на рынок, тогда и будем думать, в т.ч. и исходя из обобщенных производителем данных КИ.
-
@ilya-antipin, Вась Вась, спасибо за ответы!
-
@h-clinic
подскажите, пожалуйста, в Питере тоже можно сдать анализ на резистентность при низкой ВН?
-
@alexs73
нет. Только Москва
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
@alexs73
нет. Только Москвану они клинику и в Питере открыли, вдруг… За вопрос денег не берут :-)
-
@alexs73 смотря что такое маленькая вирусная нагрузка.!
При нагрузке в 500 думаю, что можно.
При нагрузке ниже 500,скорее всего нет
-
@alexs73 Я штудировал этот вопрос.
Девушка на стойке не компетентные в этих вопросах.
Там точно не сдадите (Питер)
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
При нагрузке в 500 думаю, что можно.
При нагрузке ниже 500,скорее всего нетДобрый вечер.
При нагрузке в 500 копий можно сделать и по РНК, а при неопределяемой только по ДНК. Генотипирование это дорогой анализ и делают его по определенным показаниям, например перед переходом на двойную схему. Если показания есть и есть необходимость сделать его, напишите мне на [email protected]
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
@alexs73 Я штудировал этот вопрос.
Девушка на стойке не компетентные в этих вопросах.
Там точно не сдадите (Питер)так я поэтому и не девушке на стойке этот вопрос задал :-)))))))
-
Участник @mimi написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
@alexs73 смотря что такое маленькая вирусная нагрузка.!
При нагрузке в 500 думаю, что можно.
При нагрузке ниже 500,скорее всего нетмаленькая - это 62
-
@alexs73 Добрый день!
нагрузка в 62 … по ДНК можно только в Москве.
В этой ветке есть координаты.
В плане комфорта прохождения было все организованно. Быстро и комфортно.
Данный вид анализа мне пригодился для дальнейшего лечения!
-
Добрый день, подскажите где в городе Киеве можно сделать анализ на вирусную нагрузку?
-
@kukolka здравствуйте, можно платно в сц на ул. Отдыха, стоит 1200 гривен. Но там карантин вроде
-
@oleg41 точно никакие заборы крови не производятся
-
@ladymusik63 разве они не возобновили работу с прошлого понедельника?
-
Эта запись удалена!
-
Эта запись удалена!
-
@ladymusik63 а что говорят, когда откроются?
-
Сдал сегодня на ИС и ВН, получил препараты на 3 месяца🙏🏼
-
@oleg41 ничего и никто не знает🤖
-
Эта запись удалена!
-
@ladymusik63 да написал в другой теме:)
ВН как всегда через неделю, ИС-690 кл (40%)… на терапии 15 месяцев ( Атрипла), начинал со 188 клеток и 13%
-
Здравствуйте!
Подскажите, пожалуйста, сдал анализ на резистентность к ИП, ННИОТ и НИОТ.
Пришел следующий результат:
Я правильно понимаю, что все эти
препараты работают в отношении моего типа ВИЧ?
Те мутации которые обнаружили, они не критичны при выборе препаратов?
-
Участник @maxim775 написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Я правильно понимаю, что все эти
препараты работают в отношении моего типа ВИЧ?
Те мутации которые обнаружили, они не критичны при выборе препаратов?Верно понимаете. Мутации полиморфизма не являются важными. Изолированная мутация A62V, обнаруженная у Вас, не несёт значимых рисков при отсутствии других, которые она могла бы усилить.
Немного снижается чувствительность к НИОТам (на 5%), но это не считается значимым.Вот что написано про неё в Стэнфордской базе HIVDB:
A62V is an accessory mutation that often occurs in combination with the multi-NRTI resistance mutations K65R or Q151M. A62V is widespread in subtype A viruses in former Soviet Union countries but A62 is otherwise non-polymorphic.
-
Участник @h-clinic написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
Мутации полиморфизма не являются важными.
Не являются важными, но не всегда/до поры. Т.е. их наличие может играть за или против, в некоторых случаях, при наличии RAVs-мутаций, а также их наличие иногда говорит о том, сколько хопов до большой мутации. Т.е. данные эти в некоторых ситуациях могут оказаться небесполезными, на сегодня же – все прекрасно, не делать грубых ошибок, и так и будет.
-
@h-clinic спасибо Вам большое!
@ilya-antipin Илья Игоревич, спасибо большое! Я верно понимаю, что с этими данными, можно относительно спокойно стартовать с двойной схемы DTG+3TC или DTG+FTC? ВН 26000, ИС 430, 22%
-
Участник @maxim775 написал в Анализ на резистентность при низкой вирусной назгруке:
можно относительно спокойно стартовать с двойной схемы DTG+3TC или DTG+FTC? ВН 26000, ИС 430, 22%
Да, можно. Ещё бы желательно убедиться, что у Вас нет гепатита В и есть защитный титр антител…
-
@maxim775 хоть боком, хоть задом.
-
Доброго времени суток!
Подскажите, пожалуйста, имеет ли смысл сдавать тест на резистентность спустя 10 месяцев после инфицирования ВИЧ? Или результат будет некорректным?
-
@foxd может быть не показательным уже, но это вероятностная история. Для теста по ДНК вроде бы как и без разницы, там найдется скорее всего, хотя… нужно уточнять, тут смотря кого сортировать для ловли ДНК, какие клетки… сложно, а вот в плазме может уже вариант без терапии потерять мутации устойчивости за 10 месяцев острого периода, но там считать вероятность нужно, что-то теряется быстро (но в долгоживущих клетках оно все будет, если что, чтобы понимать), что-то почти не теряется.
Как видите, M184V можно профукать довольно быстро, в 10 месяцев уложится вообще не проблема, а какие ревертанты T215 появятся черт знает когда… и так далее.
-
@ilya-antipin спасибо!
Я пока что не на терапии, ИС и ВН ещё позволяют. Инфекционист считает, что до года, после инфицирования ВИЧ, можно делать этот анализ. Вы бы всё таки рекомендовали его сделать в моем случае? Анализ дорогостоящий.
-
@foxd да можно и через 10 лет и через 25. Вероятность сохранить мутации устойчивости, если таковые были, и там не нулевые. Я о том, что нельзя утверждать, что точно все так, как было на момент инфицирования через 1- месяцев, вот, как видите выше по кривым. Однако, с высокой долей вероятности, если что-то значимое есть, то оно будет поймано. Имеет смысл.
-
@ilya-antipin спасибо большое, Илья Игоревич! Сделаю анализ на всякий случай.
Кратко – мы существуем только потому, что вы нам помогаете и пока вы нам помогаете. Как поддержать проект? Любая банковская карта, или баланс телефона, нажать на кнопку, а дальше все просто – Яндекс.Деньги все подскажут: А еще есть опция оформить автоматический ежемесячный донат от 100 рублей (передумаете – можно легко отключить): Спасибо! Возникли вопросы – напишите [email protected]. И еще....